Abstract
Dementie, waaronder Alzheimer, frontotemporale, vasculaire en Lewy-body dementie, wordt gekarakteriseerd door neuronverlies en cognitieve achteruitgang, maar effectieve behandelingen ontbreken. Data suggereren dat afwijkingen in cellulaire trajecten bijdragen aan ziekteprogressie. Door deze trajecten te integreren, willen we gedeelde paden en ziekte-specifieke mechanismen onthullen voor gerichte behandelingen. We gebruiken scRNA-seq & scATAC-seq-gegevens en geavanceerde methoden zoals manifold alignment om trajecten te modelleren, bifurcaties te identificeren & therapeutische doelen aan te wijzen. Onze aanpak omvat: (1) Het ontwikkelen van een methode om cellulaire trajecten te onderscheiden, (2) Het identificeren van ziekte-specifieke bifurcaties, (3) Het ontdekken van moleculaire mechanismen & (4) Het vinden van therapeutische doelen. We hypothiseren dat cellulaire trajecten gemapt kunnen worden op hyperbolische ruimten, wat overeenkomsten & verschillen tussen ziekten onthult. Interpreteerbare technieken helpen moleculaire inzichten te koppelen aan therapeutische doelen voor vroege interventie. Dit project biedt een kader voor het begrijpen van afwijkingen in cellulaire trajecten, het identificeren van gedeelde & unieke moleculaire mechanismen, en het verbeteren van vroege diagnose en behandeling van dementie.
Onderzoeker(s)
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)