Abstract
De indrukwekkende biodiversiteit die we vandaag de dag waarnemen is het resultaat van soortvorming. Reproductieve isolatie tussen soorten is het resultaat van de interactie van meerdere processen die de fitness van hybriden verminderen. Er is een toenemende beschikbaarheid van grootschalige genomische informatie van niet-modelorganismen. Op dit moment ontbreekt het ons echter aan de methodologische middelen om deze te gebruiken om de genetische basis van reproductieve isolatie te ontcijferen. Ik stel voor om computationeel efficiënte, modelgebaseerde inferentie van soortvorming te ontwikkelen door gebruik te maken van de recente vooruitgang in voorouderlijke recombinatiegrafieken (ARGs). Het gebruik van ARGs maakt preciezere en efficiëntere modellering mogelijk, waardoor demografische effecten losgekoppeld kunnen worden van selectie tegen genetische vermenging. Hoewel de potentiële toepassingen van ARG's in soortvormingsonderzoek veelbelovend zijn, blijft deze benadering onontgonnen terrein. In dit project wil ik deze leemte opvullen door het ARG-raamwerk aan te passen voor de studie van soortvorming. Ik zal nieuwe ARG-gebaseerde methodes ontwikkelen om selectie tegen genetische vermenging te modelleren en deze methoden toepassen op het iconische studiesysteem van de adaptieve radiatie van Malawi cichliden. In het bijzonder zal ik de genetische basis van reproductieve isolatie onderzoeken en of beginnende diversifiërende selectie optreedt als gevolg van intense visserijdruk.
Onderzoeker(s)
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)