Abstract
Ondanks hun lage taxonomische diversiteit vertoont het menselijke vaginale microbioom een uitzonderlijke veerkracht en stabiliteit, wat traditionele ecologische paradigma's uitdaagt. Dit PhD-project onderzoekt hoe ecologische processen, zoals lokale selectie en dispersie, de samenstelling van vaginale microbiële gemeenschappen op soort- en stamniveau beïnvloeden. Door stalen en gegevens via burgerwetenschap te analyseren, richt deze studie zich op netwerken van 240 genetisch en sociaal verbonden individuen, waarmee het de eerste studie is die vaginale microbiële netwerken onderzoekt. Eerst zal ik onderzoeken hoe genetische verwantschap, sociale interacties en selectiedruk de microbiële samenstelling beïnvloeden. Vervolgens zal ik de verspreidingsdynamiek van vaginale stammen tussen deze individuen en langs de darm-vagina-as bestuderen. Ook zal ik de veerkracht en stabiliteit van deze gemeenschappen onderzoeken via in vitro en in vivo benaderingen, zoals synthetische gemeenschappen en langetermijn-evolutie-experimenten. Daarnaast wordt een evolutionaire klok geoptimaliseerd om mutatiegedreven adaptatie van recombinatie-evenementen te onderscheiden, wat helpt bij het nauwkeuriger karakteriseren van het delen van stammen en stam-evolutie. Dit onderzoek biedt waardevolle inzichten in de ecologie en evolutie van vaginale microbiële gemeenschappen en verdiept ons begrip van hun stabiliteit en veerkracht.
Onderzoeker(s)
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)