Onderzoeksgroep
Expertise
Ik doe onderzoek naar bio-informatica voor massaspectrometrie-gebaseerde proteomics, met als doel het onderzoek naar de eiwitsamenstelling in biologische stalen of weefsels te ondersteunen. Ik ontwikkel computationele methoden om moeilijk te interpreteren massaspectrometrie-data beter te analyseren. Daarbij richt ik me vooral op de annotatie van posttranslationele modificaties en immunopeptiden, die van belang zijn in onder meer infectieziekten en kankeronderzoek. Daarnaast verdiep ik me in de ethische aspecten van massaspectrometrie-data, nu deze technologie steeds vaker klinisch toegepast wordt.
Privacy in proteomics: bewaken van persoonlijke identificeerbare informatie in klinische omics data.
Abstract
De vooruitgang in massaspectrometrie-gebaseerde proteomics heeft de studie van complexe biologische systemen gerevolutionariseerd en de karakterisatie van duizenden eiwitten in één enkel experiment mogelijk gemaakt. Recent zijn er belangrijke vragen aan het licht gekomen over de her-identificeerbaarheid van individuen via hun proteoomdata. In tegenstelling tot genomics en transcriptomics, zijn de risico's rond privacy in proteomics grotendeels ongekend. Geïnspireerd door technieken uit het veld van gezichtsherkenning, stel ik een nieuwe aanpak voor om risico's op inbreuk van privacy in klinische proteoomdata op te sporen. Vervolgens ga ik een methode ontwikkelen om deze data te de-identificeren en zo deze risico's te minimaliseren en de bruikbaarheid van de data te vrijwaren. Hiermee staat dit project aan de basis van een opkomend vakgebied. Het behandelt een probleem dat een belangrijk aandachtspunt zal worden in de nabije toekomst, met een wereldwijde toename aan publiek beschikbare en steeds gedetailleerdere proteoomdata. De resultaten van deze studie zullen bijdragen aan hoe dit veld wetenschappelijke vernieuwing kan blijven voortduwen, terwijl de individuele privacy beschermd blijft. Dit project kan leiden tot nieuwe standaarden in proteomics voor het voeren van privacy-bewust onderzoek en kan de basis vormen voor biomedische wetenschap die zowel impactvol als ethisch duurzaam is.Onderzoeker(s)
- Promotor: Bittremieux Wout
- Co-promotor: Laukens Kris
- Mandaathouder: Adams Charlotte
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject