Onderzoek Kris Van Alsenoy

Abstract

De doelstelling van dit project is het ontwikkelen van nieuwe exchange-correlatie functionalen, gebruikmakend van data uit post-HF gecorreleerde methoden. Het project is ingedeeld in drie fasen, waarbij in de eerste fase een exchange-functionaal zal ontwikkeld worden die in staat is om de exacte Hartree-Fock exchange-energie te reproduceren, gebaseerd op ideeën voorgesteld door Springborg en Dhal in 1999 welke echter tot op heden niet geïmplementeerd werden. In de tweede fase zal, met een gelijkaardige werkwijze, een correlatie-functionaal ontwikkeld worden, gefit op de MP2 energie-correctie. Hierbij is een uitbreiding tot hogere ordes in een later stadium mogelijk. In de derde en belangrijkste fase van het project zullen ook de elementen van de MP2-gecorrigeerde dichtheidsmatrix in de vorm van een functionaal in de SCF cyclus meegenomen worden, wat toelaat om het Kohn-Sham formalisme uit te breiden naar het gebruik van fractionele bezettingen voor orbitalen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Krishtal Alisa

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Geconjugeerde organische en organometallische verbindingen en hun stabiele radicalen, toepasbaar als organische halfgeleiders, zullen gesynthetiseerd worden en gekarakteriseerd d.m.v. geavanceerde gepulste en multi-frequentie EPR technieken. De combinatie hiervan met all-electron DFT kwantumchemische berekeningen is essentieel om alle in de spectroscopische gegevens beschikbare structurele informatie vervat ten volle te kunnen benutten..

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Co-promotor: Blockhuys Frank
• Co-promotor: Goovaerts Etienne
• Co-promotor: Van Doorslaer Sabine

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van dit onderzoek is het begrijpen van verbanden tussen structuur, dynamica, biologische activiteit alsook de toxiciteit van proteïnen van de familie van crambin. De biochemische functie en de toxiciteit van de proteïnen in deze familie zijn nog onvoldoende gekend en hebben mogelijk een therapeutisch potentieel. Moleculaire dynamica simulatie zullen toelaten deze informatie te halen uit un infra-rood absorptie spectra. Op basis van klassieke dynamica berekeningen voor proteïnen van deze familie in verschillende physiologische condities zullen een aantal beginstructuren gegenereerd worden die in een later stadium in een kwantum-studie zullen verfijnd worden. Het IR-spectrum en de verschillende reactiviteits indices zullen dan berekend worden aan de hand van de QM/MM code ontwikkeld in de UA-deelgroep van dit project.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van dit project is het begrijpen van verbanden tussen structuur, dynamica, biologische activiteit alsook de toxiciteit van proteïnen van de familie crambin. De biochemische functie en de toxiciteit van de proteïne in deze familie zijn nog onvoldoende gekend en hebben mogelijk een therapeutisch potentieel. Moleculaire dynamica simulaties zullen toelaten deze informatie te halen uit hun infra-rood absorptie spectra. Op basis van klassieke dynamica berekeningen voor proteïnen van deze familie in verschillende fysiologische condities zullen een aantal beginstructuren gegenereerd worden die in een later stadium in een kwantum-studie zullen verfijnd worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De structuurbepaling van biomoleculen is een belangrijke aspect binnen de biochemische wetenschappen, dit vermits de driedimensionale structuur van een molecule een determinerende invloed heeft op verschillende van zijn chemische eigenschappen waaronder de reactiviteit. De meest gebruikte experimentele techniek voor het bepalen van structuren is een-kristal X-straal diffractie. Het is echter geweten dat de verkregen kristalstructuren meestal niet overeen stemmen met de structuur van de moleculen in oplossing welke de actieve structuur is die het molecule aanneemt in het waterig milieu van de cel. Recente ontwikkelingen in de NMR spectroscopie, waaronder de Fourier transformatie methoden en pulstechnieken, maken deze techniek zeer geschikt voor het bepalen van conformaties van biomoleculen in oplossing. Zo kunnen bovendien ook structuren bepaald worden van moleculen waarvan geen een-kristallen kunnen gemaakt worden. Het interpreteren van NMR spectra voor het bepalen van de driedimensionale structuur is echter niet triviaal. Het verband tussen de conformatie en NMR parameters als chemische verschuivingen en koppelingsconstanten is tot nu toe enkel op empirische wijze bepaald. Oit komt door het groot aantal factoren die een invloed hebben op deze grootheden, zoals bijvoorbeeld de invloed van de lokale omgeving en lange afstand substituenteffecten op de chemische verschuiving alsook de invloed van conformationele effecten op de koppelingsconstanten. Bovendien moeten verschillende experimentele technieken toegepast worden om aile chemische verschuivingen en koppelingsconstanten nauwkeurig te bepalen, dit wegens overlap, uitmiddelingseffecten, enzoverder. Het berekenen, met behulp van kwantumchemische methoden, van chemische verschuivingen en koppelingsconstanten en de opsplitsing van deze grootheden in hun verschillende bijdragen kunnen het interpreteren van de experimentele spectra sterk vereenvoudigen maar bovendien eveneens helpen bij het verschaffen van inzicht in het verband tussen de spectra en de structuur. De toewijzing van chemische verschuivingen en koppelingsconstanten kan eenduidig gebeuren en de verschillende bijdragen tot deze grootheden kunnen afzonderlijk bepaald worden. Dit heeft een groot voordeel bij atypische situaties die niet kunnen vergeleken worden met bekende data, zoals bij sterische hindering of bij aanwezigheid van relatief zeldzame chemische elementen. NMR spectra van verschillende elementen die niet routinematig gemeten worden, kunnen verkregen worden zonder de noodzaak aan aanrijking of speciale apparatuur.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Cuyt Annie
• Co-promotor: Daelemans Walter
• Co-promotor: De Schutter Erik
• Co-promotor: Peeters Francois
• Co-promotor: Van Alsenoy Kris
• Co-promotor: Van Broeckhoven Christine

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Vertrekkend van ab-initio berekeningen en bij gebruik van verschillende exchange-correlatie functionalen zal inzicht verkregen worden in het mechanisme dat polarisatie beschrijft in een proteine-water systeem, in het bijzonder de inter-moleculaire ladingstransfer. De bekomen resultaten zullen vervolgens gemodelleerd worden door multipool modellen welke kunnen gebruikt worden in moleculaire dynamica similaties van proteine-water complexen bij niet-nul temperaturen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Yang Mingli

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Implementatie en optimalisatie van het parallelle softwarepakket BRABO voor het doorvoeren van ab- initio berekeningen aan.meer-electron systemen. De gebruikte methodologie omvat zowel een golffunctie als een beschrijving gebaseerd op 'Density Functional Theory'. Speciale aandacht wordt besteed aan de efficiëntie bij implementatie op een cluster van linux pc's.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

In dit project worden drie nieuwe klassen van materialen voor conductometrische gassensoren gesynthetiseerd en praktisch getest, waarvan ab initio berekeningen gunstige eigenschappen, zoals hoge stabiliteit en goede verwerkbaarheid hebben voorspeld. Het betreft materialen gebaseerd op : i)2,6-difenyl-1,5-diaza-1,5-dihydro-s-indaceen ii)aryleenvinyleenachtige trimeren met N-methylpyrrool als centrale ring iii)fenyleen-nikkel(II) complexen Voor elk van de voorgestelde nieuwe verbindingen zullen meerdere syntheseroutes worden onderzocht.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Vande Velde Christophe

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De Schrödinger-vergelijking, die kwantumchemische informatie geeft over systemen, kan niet exact worden opgelost voor moleculen. Een veel gebruikte benaderingsmethode is de Hartree-Fock methode, die zeer efficiënt kan worden gebruikt in combinatie met de in onze onderzoeksgroep ontwikkelde multiplicatieve integraal approximatie (MIA). Op het Hartree-Fock-niveau wordt de zogenaamde correlatie-energie echter niet in rekening gebracht en de DFT-methode is een methode die hiervoor een oplossing biedt aan een aanvaardbare computationale kost. De MIA-methode is tot op heden enkel toepasbaar voor energieberekingen. Krachten zijn echter noodzakelijk voor het uitvoeren van geometrieoptimalisaties en het berekenen van o.a. vibrationele gegevens. Het ontwikkelen van de MIA-krachten, de optimalisatie van de DFT-krachtencode en de ontwikkeling van een DFT/MIA-krachten methode, vormen het doel van dit project. De methodes zullen dan worden aangewend voor studies in het kader van farmaceutisch en materiaalonderzoek.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Van Droogenbroeck Joris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Een QM/MM methode zal geïmplementeerd worden door het verbinden van het QM-programma BRABO en het MM-programma CHARMM. Een Link-Atom-methode zal geïmplementeerd worden om een moleculair systeem te kunnen opsplitsen in een QM- en een MM-component indien hierbij covalente bindingen gebroken. Uiteindelijk zullen polarisatietermen toegevoegd worden aan het MM-krachtveld zodanig dat de QM-component verder kan verkleind worden en een moleculaire dynamica simulatie kan.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Swerts Ben

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Lamoen Dirk
• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: March Norman H.

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Met als objectief nieuwe luminescente materialen voor blauw emitterende OLEDs te bekomen, zullen een aantal graftpolymeren worden gesynthetiseerd en hun prestaties worden vergeleken met deze van mengsels van luminescente oligomeren in een polymere matrix. De graftpolymeren zullen bestaan uit derivaten van 1,4-bis?2,2-diphenylethenyl?benzeen als de chromoforen, geënt in verschillende belading ' en op hetzij een copolymeer van vinylbenzylchloride (VBC) met vinylcarbazool, hetzij een copolymeer van VBC met styreen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Geise Herman
• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Wuyts Cindy

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Met de nadruk op LEDs, sensoren en zonnecellen, heeft het project twee objectieven : (i) het ontwerpen en synthetiseren van nieuwe 'advanced materials' daarbij geholpen door theoretische (ab-initio HF en DFT) berekeningen en (ii) het construeren en testen van verbeterde, efficiënte en lang levende apparaten met behulp van nanotechnologie.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Geise Herman
• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Naast de uitwisseling van onderzoekers en informatie, beoogt het project de synthese van nieuwe organische materialen : (i) calix[n]pyrrolen, arylboronzuren, dendrimeren (KUL) en (ii) geconjugeerde oligomeren en polymeren die vinylthiofenen omvatten, naast vinylarylgroepen en hun acetyleen analoga (UIA). De materialen zullen getest worden (PAN, Polen) in gemodificeerde membranen op het herkennen van ionaire en neutrale species.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Geise Herman
• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het voorgestelde project beoogt een gecombineerde theoretische en experimentele studie door te voeren van phosphor houdende verbindingen in organometalische verbindingen. Voor wat betreft de te gebruiken theoretische methodologie zullen een aantal complementaire methoden gebruikt worden : state-of-the-art MO technieken zoals QCI, CC en CASPT2 maar ook studies op basis van DFT hierbij gebruik makend van de meest recente exchange-correlatie functionalen. Experimentele studies (vibrationeel IR en NMR) zullen uitgevoerd worden op dit type verbindingen en de bekomen resultaten geinterpreteerd op basis van theoretische berekeningen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

In dit project zal een aanvang gemaakt worden van de uitbreiding van DFT naar de beschrijving van geexiteerde toestanden en `N-representable' densiteits matrices. Met het oog op het beter begrijpen van optische eigenschappen van halfgeleiders zullen correlatie effecten op exitonen en spin transport bestudeerd worden. Het lange-afstand character van coulomb interacties zal bestudeerd worden aan de hand van studies van magnetische effecten op clusters van 3d transitie metalen. Tenslotte zullen om de performatie van een aantal DFT-functionalen te evalueren, studies doorgevoerd worden aan moleculen en clusters van belang voor de farmaceutische industrie en de nano-technologie sector.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Peeters Anik

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het project wil het experimentele onderzoek aan gassensoren en een elektronische neus op basis van elektrisch geleidende oligomeren van een theoretische achtergrond voorzien, zodat het experimentele werk gerichter, in tegenstelling tot volledig empirisch, kan worden uitgevoerd. Specifiek wil dit zeggen dat er zal getracht worden inzicht te verwerven in de verzameling voorwaarden waaraan een gegeven oligomeer moet voldoen om als gassensor te kunnen worden toegepast: met deze voorwaarden worden in het bijzonder de stabiliteit, de afzetbaarheid en de gevoeligheid van het gedopeerde materiaal voor interacties met moleculen in de gasfase bedoeld.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Blockhuys Frank

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van dit project is een aantal theoretische methoden en technieken welke gebruikt worden in verschillende domeinen van de wetenschap zoals kwantumchemie, vaste stof fysica en statistische fysica, met betrekking tot de studie van moleculen en materialen, samen te brengen in een coherent software pakket dat zal toelaten een brede waaier van industriële problemen te bestuderen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het samenwerkingsproject tussen het Instituut Fotografische Chemie, Chinese Acad. Wetenschappen enerzijds en IMEC (Leuven) en Structuurchemie (UIA, Univ. Antwerpen) anderzijds heeft de volgende objectieven: 1. Synthese van nieuwe ladingstransporterende en licht emitterende materialen uit de groep aryleenvinylenen en metaalchelaten 2. Evaluatie van de nieuwe materialen in Organische LED's en zonnnencellen. 3. Ontwerpen van procedures om nieuwe en bestaande organische halfgeleidermaterialen te maken en te testen in veld-effect transistoren

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Nieuw (ab-initio) methoden gebaseerd op de MIA-aanpak worden ontwikkeld. Deze methoden worden toegepast in de studie van ofwel biochemische of farmaceutische moleculen zoals neuroleptica, steroiden en kleine peptiden ofwel in de studie van moleculaire kristallen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Een QM/MM methode zal geïmplementeerd worden door het verbinden van het QM-programma BRABO en het MM-programma CHARMM. Een Link-Atom-methode zal geïmplementeerd worden om een moleculair systeem te kunnen opsplitsen in een QM- en een MM-component indien hierbij covalente bindingen gebroken. Uiteindelijk zullen polarisatietermen toegevoegd worden aan het MM-krachtveld zodanig dat de QM-component verder kan verkleind worden en een moleculaire dynamica simulatie kan

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Swerts Ben

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De Schrödinger-vergelijking, die kwantumchemische informatie geeft over systemen, kan niet exact worden opgelost voor moleculen. Een veel gebruikte benaderingsmethode is de Hartree-Fock methode, die zeer efficiënt kan worden gebruikt in combinatie met de in onze onderzoeksgroep ontwikkelde multiplicatieve integraal approximatie (MIA). Op het Hartree-Fock-niveau wordt de zogenaamde correlatie-energie echter niet in rekening gebracht en de HFCC-methode is een methode die hiervoor een oplossing biedt. Zowel de MIA- als de HFCC-methode zijn tot op heden enkel toepasbaar voor energieberekingen. Krachten zijn echter noodzakelijk voor het uitvoeren van geometrieoptimalisaties en het berekenen van o.a. vibrationele gegevens. Het ontwikkelen van de MIA-krachten en de HFCC-krachten alsook de ontwikkeling van een combinatiemethode, de HFCC/MIA-methode, vormen het doel van dit project.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Van Droogenbroeck Joris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Aryleenvinylenen (AV) bestaan afwisselend uit een aromatische ring en een olefinische schakel en hebben interessante electronische en optische eigenschappen. Zij worden daarom geplaatst in de groep 'Advanced Materials for Smart Devices'. Voorbeelden van toepassingen zijn organische 'light emitting devices (OLED)' en organische sensoren. Met in eigen huis gesynthetiseerde AV-derivaten maakte de groep Structuurchemie reeds OLED's in diverse kleuren, blauw inclusief, en slaagde zij erin conductimetrische gassoren te bouwen op basis van AV-polymeren en zelfs op basis van pure oligomeren. Deze laatste vondst leidde tot octrooiaanvragen in Europa en de VS. Fundamenteel onderzoek van de struktuur-eigenschapsrelaties blijft de hoeksteen om de efficiëntie van deze materialen te verhogen en hun veroudering te vertragen. Deze doelstellingen willen we verwezenlijken door: (i) Gebruik van theoretische methoden bij ontwerp en optimalisatie van chemische structuren en syntheseroutes. (ii) Synthese van nieuwe verbindingen en dunne films, optimalisatie van syntheseroutes en zuiveringsmethoden. (iii) Bepaling en verbetering van electronische eigenschappen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Co-promotor: Geise Herman

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Geometrie optimalisaties gebaseerd op analytische gradienten gebeuren op basis van een Newton-Raphson procedure die, op iteratieve wijze, vertrekkend van een gegeven geometrie en bijhorende gradienten de berekening van een 'nieuwe'/'betere' geometrie toelaat. De berekening van analytische gradienten in elke stap van deze iteratieve procedure is voor grotere systemen een zeer rekenintensieve stap. Ondervinding heeft uitgewezen dat de geometrie van bepaalde regios van grotere moleculen sneller convergeren dan andere. In princiepe is het dus niet nodig om krachten op de atomen van deze regios opnieuw uit te rekenen. Een procedure gebaseerd op de uitdrukking : F(n) - F(n-1) = P(n) ( I(n)-I(n-1)) + (P(n) ' P(n-1)) I(n-1) waarbij F(m), P(m) en I(m) respectievelijk staan voor krachten, density matrix en integralen in de m-de iteratie, werd in het bijzonder voor de electron repulsie integralen uitgewerkt.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Perez-Juste Ignacio

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De "Local Density Approximation" (LDA) van "Density Functional Theory" is in het verleden met groot succes gebruikt om de eigenschappen van atomen, moleculen, polymeren en vaste stoffen te berekenen. Tot nu toe werden de toepassingen van deze benadering in hoofdzaak behandeld door GGA-correcties. Het is de bedoening van dit project om de LDA/GGA benadering toe te passen op complexe systemen zoals clusters, quantum dots, polymeren, enz. en om nieuwe en betere functionalen te ontwikkelen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

State-of-the-art quantum chemische methoden zullen aangewend worden teneinde de electronische structuur en eigenschappen van laag-valente fosfor verbindingen te bestuderen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

In dit project zullen de elastische eigenschappen berekend worden van industriele polymeren zoals de nylons 11, 12 en 66. De modulus van Young zowel als alle andere elastische constanten zijn evenredig met de tweede afgeleide van de totale energie naar de trek uitgeoefend op het materiaal. De grondtoestandsenergie wordt berekend m.b.v. een LDA functionaal (Kohn-Sham voor exchange en Ceperley-Alder voor correlatie).

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het onderzoeksproject omvat de ontwikkeling van nieuwe methoden en algoritmen die bruikbaar zijn bij het voorspellen van de structuur van eiwitten waarvoor de aminozuursequentie gekend is. Eerst zal de secundaire structuur van een eiwil bepaald worden door de kwantumchemische studie van de geometrie van de oligomeren waaruit het eiwit is opgebouwd. Om vervolgens een betrouwbare voorspelling te kunnen maken van de tertiaire structuur zal gebruik gemaakt worden van neurale netwerken. Na de berekening van het potentiaaloppervlak van het actieve centrum kan een tijdsgemiddelde effectieve conformatie bepaald worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Peeters Anik

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van dit project is het ontwikkelen en implementeren van een methode die de DFT methode en de MIA methode combineert. De MIA methode is een computationele procedure die ab-initio berekeningen aan zeer grote systemen toelaat. De DFT/MIA methode zal nauwkeurige berekeningen aan zeer grote systemen toelaten waarbij het effect van elektronencorrelatie op een efficiente wijze wordt bepaald.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Rousseau Bart

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Zeven Vlaamse onderzoeksgroepen: Antwerp (Van Alsenoy, Lamoen), Leuven (Ceulemans, Schoonheydt), Gent(Waroquier,Bultinck) en Brussel (Geerlings) vormen een onderzoeksgemeenschap met als centraal thema "Density Functional Theory" waarin zij zowel interdisciplinariteit (Scheikunde Natuurkunde - Computer wetenschap) als complementariteit (fundamentele/toegepaste aspecten, substraten (moleculen/vaste stoffen) nastreven.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Het doel van dit project is het ontwikkelen en implementeren van een methode die de DFT methode en de MIA methode combineert. De MIA methode is een computationele procedure die ab-initio berekeningen aan zeer grote systemen toelaat. De DFT/MIA methode zal nauwkeurige berekeningen aan zeer grote systemen toelaten waarbij het effect van elektronencorrelatie op een efficiente wijze wordt bepaald.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Rousseau Bart

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Density Functional Theorie (DFT) zal gebruikt worden voor de studie van structurele, mechanische en electronische eigenschappen van vaste stoffen, polymeren en bio-polymeren. Uitbreiding van de "local density approach" door gebruik van exponentieel of gaussiaans gescreende functionalen zal onderzocht worden. De Multiplicatieve Integraal Benadering (MIA) zal gebruikt worden om de computationele efficientie te verhogen en verschillende "niet-locale" DFT functionalen zullen uitgetest en gecalibreerd worden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Co-promotor: Geise Herman
• Co-promotor: Martin Jan

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Nieuw (ab-initio) methoden gebaseerd op de MIA-aanpak worden ontwikkeld. Deze methoden worden toegepast in de studie van ofwel biochemische of farmaceutische moleculen zoals neuroleptica, steroiden en kleine peptiden ofwel in de studie van moleculaire kristallen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Gebruik van de gecombineerde MIA en direct-SCF aanpak bij de ontwikkeling van programmatuur die ab-initio berekeningen toelaat aan grote biochemische en farmacologisch interessante moleculen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Recente verbeteringen in de quantum theorie van de materie laat de simulatie en het ontwerpen van nieuwe materialen toe. Hiervoor wordt gebruik gemaakt van de 'density functional' theorie, meer bepaald de 'local density approximation' waarin de totale energie van het systeem uitgedrukt wordt in functie van de elektrondichtheidsfunctie. Dit project past deze methode toe m.b.t. (bio)polymeren.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Doren Victor
• Co-promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Gebruik van bestaande software en ontwikkeling van nieuwe software voor de studie van electronische en mechanische eigenschappen van grote systemen met behulp van "Density Functional" theorie. In het bijzonder zal de invloed nagegaan worden van niet-lokale densiteitsfunctionalen (generalized gradient expansion, exponentieel en gaussische gescreende densiteitsfunctionalen) op de hoger genoemde grootheden.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Gebruik van een gecombineerde MIA en directe-SCF aanpak voor de ontwikkeling van software die toelaat MP2 berekeningen uit te voeren met het oog op het bestuderen van dynamische eigenschappen van moleculen en kristallen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Peeters Anik

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Gebruik van gecombineerde MIA en directe SCF aanpak bij de ontwikkeling van programmatuur die ab-initio berekeningen toelaat aan grote biochemische en farmacologisch interessante moleculen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De multiplicatieve integraal benadering, die haar bruikbaarheid bewezen heeft voor de SCF-berekening van moleculaire orbitalen van grote systemen wordt uitgebreid tot de evaluatie van energie contributies ten gevolge van electron correlatie. Dit gebeurt op het MP2 niveau.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Franckaerts Katrien J M

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Om ab initio berekeningen aan grote, biologisch interessante moleculen aan te kunnen, dient men gebruik te maken van supercomputers en speciale methoden. De multiplicatieve integraalbenadering, oorspronkelijk ontwikkeld om self-consistent field berekeningen te versnellen, zal ook nuttig blijken bij de evaluatie van de krachten op de kernen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Peeters Anik

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

De multiplicatieve integraal benadering, die haar bruikbaarheid bewezen heeft voor de SCF-berekening van moleculaire orbitalen van grote systemen wordt uitgebreid tot de evaluatie van energie contributies ten gevolge van electron correlatie. Dit gebeurt op het MP2 niveau.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Franckaerts Katrien J M

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Nieuwe (ab-initio) methoden gebaseerd op de MIA-aanpak worden ontwikkeld. Deze methoden worden toegepast in de studie van ofwel biochemische of farmaceutisch interessante moleculen zoals neuroleptica, steroiden en kleine peptiden ofwel in de studie van moleculaire kristallen.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Geise Herman
• Mandaathouder: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Om ab initio berekeningen aan grote, biologisch interessante moleculen aan te kunnen, dient men gebruik te maken van supercomputers en speciale methoden. De multiplicatieve integraalbenadering, oorspronkelijk ontwikkeld om self-concistent field berekeningen te versnellen, zal ook nuttig blijken bij de evaluatie van de krachten op de kernen

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris
• Mandaathouder: Peeters Anik

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Ontwikkeling van methoden die toelaten met behulp van de ab-initio gradient methode, de structuur te berekenen van moleculen met biochemisch belang.

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject

Abstract

Onderzoeker(s)

• Promotor: Geise Herman
• Mandaathouder: Van Alsenoy Kris

Onderzoeksgroep(en)

Project type(s)

• Onderzoeksproject