Onderzoeksgroep
Expertise
Bacteriële infecties spelen een belangrijke rol in verschillende longaandoeningen, waaronder community-acquired pneumonie. Om de longen te infiltreren produceren bacteriële pathogenen talloze proteasen die essentieel zijn voor bepaalde functies zoals de levensvatbaarheid van cellen, fysiologie en virulentie. Een voorbeeld hiervan is Streptococcus pneumoniae, dat afhankelijk is van verschillende virulentiefactoren, waaronder het serine protease `high-temperature requirement protease A` (HtrA). De HtrA protease activiteit is cruciaal voor het afbreken van biofilms en het bevorderen van competentie, een cruciale stap in de ontwikkeling van multi-drug resistente stammen. De moleculaire mechanismen die de proteolytische activiteit van SP-HtrA tijdens verschillende infectiefasen bepalen, zijn echter nog niet volledig begrepen, voornamelijk door de beperkte methoden die beschikbaar zijn om de proteaseactiviteit van HtrA te bestuderen. Dit inzicht is niet alleen essentieel, maar ook opportuun, gezien de toenemende multidrugresistentie van pathogenen. Verschillende bewijzen tonen aan dat proteasen, in het algemeen, een cruciale rol spelen in het overleven en de kolonisatie van pathogenen. Daarom is het van vitaal belang om de voorheen onbekende virulente rol van deze proteasen op te helderen, omdat dit kan leiden tot de ontdekking van nieuwe therapeutische doelen of benaderingen. Bijgevolg is mijn onderzoek aan de Universiteit Antwerpen verdeeld in twee hoofdcomponenten: De ontwikkeling van zeer gevoelige en selectieve activiteitsgebaseerde probes (ABPs) door middel van activiteitsgebaseerde eiwitprofilering. Deze ABPs zullen de actieve site van het protease covalent modificeren, waardoor de protease splitsing in levende cellen en weefsels in real-time in beeld gebracht kan worden. De toepassing van deze ABPs, na biochemische validatie, in in vitro en in vivo infectiemodellen. Dit project omvat verschillende technieken, waaronder `solid-phase` peptide synthese, organische synthetische chemie, biochemische methoden, eiwitexpressie en -zuivering, proteomica en beeldvorming.