Onderzoeksgroep
Expertise
Mijn eerste graad ligt in de gezondheidszorg (bachelorgraad in verpleegkunde), maar vanwege mijn motivatie om een carrière in onderzoek na te streven, heb ik mijn studie in de levenswetenschappen voortgezet. Ik heb ook een MSc in Biologie en een BSc in Biochemie, die zijn uitgereikt aan de Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (Portugal). Ik heb verschillende onderzoekservaringen opgedaan, ik heb genen van planten en ongewervelde dieren (neteldieren) bestudeerd, en ook metalloproteïnen van bacteriën. Deze ervaringen hebben mijn interesse gewekt in het begrijpen van de structuur-functierelatie van enzymen. Tijdens mijn PhD-studies aan het Instituto de Tecnologia Química e Biológica António Xavier was mijn onderzoek gericht op de vervolgstappen van het Base Excision Repair (BER)-traject. Ik heb DNA-polymerase I (DrPoll) en NAD+-afhankelijke DNA-ligase (DrLigA) bestudeerd van een unieke bacterie, de extremofiele Deinococcus radiodurans. Functionele en DNA-bindingstesten in vitro werden uitgevoerd om de rol en wisselwerking van DrPolI en DrLigA in BER te analyseren. Bovendien bepaalden we de kristalstructuur van DrLigAΔBRCT (deletie van het C-terminale domein) en verkregen we een cryo-elektronenmicroscopiestructuur met lage resolutie van de DrPolI over de volledige lengte. Daarom heb ik tijdens mijn PhD-studies mijn expertise op het gebied van moleculaire biologie, biochemie en structurele biologie verbeterd. Momenteel ben ik postdoctoraal onderzoeker aan de Universiteit Antwerpen, en ik blijf mijn vaardigheden en expertise in structurele biologie en enzymologie uitbreiden voor de studie van granzymen, een familie van zeer homologe serineproteasen.
Onderzoek naar de interactie tussen menselijke Granzyme B en nieuwe krachtige remmers: structurele en kinetische analyse.
Abstract
Granzyme B (GzmB) is een serine protease betrokken bij de gerichte vernietiging van tumorcellen en wordt opgeslagen in granules van cytotoxische T-cellen (CD8+) en natuurlijke killer (NK) cellen. Na perforin-gemedieerde afgifte in het cytoplasma van de tumorcel is GzmB verantwoordelijk voor het initiëren van caspase-gemedieerde apoptose. Als zodanig is GzmB een sterke kandidaat voor het monitoren van de door tumorcellen gerichte vernietiging, wat de cytotoxische activiteit van CD8+ en NK-cellen veelbelovend maakt voor de revolutie van op cellen gebaseerde anti-kankertherapieën. Het detecteren van zowel de aanwezigheid als de activiteit van GzmB in de tumor micro-omgeving (TME) kan worden bereikt door het gebruik van enzym-specifieke activiteit-gebaseerde probes (ABPs). Echter, tot op heden zijn slechts twee van dergelijke probes ontwikkeld en is hun selectiviteit niet gevalideerd. Bovendien ontbreken details over de structurele basis van GzmB-remming door kleine moleculen, wat essentieel is om de rationele ontwikkeling van nieuwe remmers en ABPs te versnellen. Daarom streven we ernaar om kristallen te verkrijgen van GzmB in complex met een referentieremmer en de structuur van het complex op hoge resolutie te bepalen voor rationeel medicijnontwerp, en om een bibliotheek van nieuwe GzmB-remmers te genereren en karakteriseren. Onze bevindingen kunnen bijdragen aan de toekomstige ontwikkeling van een nieuwe fluorescerende ABP voor de detectie van actieve GzmB in de micro-omgeving van verschillende solide tumoren.Onderzoeker(s)
- Promotor: Pimenta Fernandes Andreia
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject