Onderzoeksgroep
Vergelijkende biochemische en functionele studie van de verschillende dipeptidyl peptidasen.
Abstract
Deze aanvraag betreft het onderzoek naar proline specifieke peptidasen. Dit project heeft de volgende concrete doelstellingen: 1.Karakterisatie van inhibitoren en selectie van krachtige en specifieke inhibitoren van aan DPP4 verwante enzymen, met name DPP8, DPP9 en FAP. 2. De studie van de expressie van verschillende DPPs (DPP2, DPP4, DPP8, FAP en DPP9) in endothelia van verschillende oorsprong en dit zowel onder normoxie als hypoxie. 3.Het in vitro bestuderen van het effect van selectieve en niet-selectieve DPP remming op endotheelcel activatie. 4. Het in vitro bestuderen van het effect van selectieve en niet-selectieve DPP remming op het collageenmetabolisme van fibroblastenOnderzoeker(s)
- Promotor: De Meester Ingrid
- Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Biochemische studie van recent ontdekte dipeptidyl peptidasen bij de mens.
Abstract
Via dit onderzoeksproject willen we bijdragen tot de karakterisering van de familie der dipeptidyl peptidasen, meer bepaald FAP, DPPII, DP8 en DP9. Het eerste luik van het project omvat voor elk van die enzymen het bestuderen van de substraatspecificiteit en efficientie van peptidesplitsing. Het tweede luik behelst het bestuderen van inhibitoren. De identificatie van peptidesubstraten en de beschikbaarheid en karakterisatie van selectieve remmers zijn belangrijk voor verder functioneel onderzoek. Afhankelijk van de resultaten zal gestart worden met het onderzoek naar de functie van een of meerdere van de peptidasen.Onderzoeker(s)
- Promotor: De Meester Ingrid
- Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Substraatspecificiteit en structuur-functierelaties in de prolyloligopeptidasefamilie van serine proteasen.
Abstract
Prolyloligopeptidase (PO) en dipeptidyl peptidase IV (DPP-IV) zijn proline specifieke peptidasen, waarvan de biologische functie verband houdt met het metabolisme van biologisch actieve peptiden. Er wordt algemeen aangenomen dat ze hun katalytische functie uitoefenen volgens het klassieke serine protease mechanisme. De specificiteit en de selectiviteit worden in belangrijke mate bepaald door de primaire bindingsplaats en een aantal subbindingsplaatsen voor aangrenzende aminozuren. De substraatspecificiteit van DPP-IV voor natuurlijke peptiden kon niet voorspeld worden op basis van deze veronderstellingen en de gegevens bekomen met kleine dipeptide-afgeleide substraten. Solvent isotoop-effecten lieten niet toe ondubbelzinnig de snelste stap in het mechanisme te identificeren. In bepaalde condities blijkt een conformatieverandering snelheidsbepalend te zijn voor de PO gekatalyseerde hydrolyse van chromogene substraten. Ook blijft de interpretatie van structuur-activiteitsrelaties van remmers moeilijk. Doel van dit project is een beter inzicht te krijgen in de details van het katalytisch mechanisme van PO en DPP-IV. Verschillende benaderingswijzen worden overwogen: kinetische experimenten, gerichte mutagenese in het actief centrum en de putatieve substraatbindingsplaatsen in PO, kwantitatieve structuur-activiteitsrelaties van remmers en liganden.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
- Mandaathouder: Brandt Inger
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Role of cytokine-serotonin, interaction in stress and depression.
Substraatspecificiteit en structuur-functierelaties in de prolyloligopeptidasefamilie van serine proteasen.
Abstract
Prolyloligopeptidase (PO) en dipeptidyl peptidase IV (DPP-IV) zijn proline specifieke peptidasen, waarvan de biologische functie verband houdt met het metabolisme van biologisch actieve peptiden. Er wordt algemeen aangenomen dat ze hun katalytische functie uitoefenen volgens het klassieke serine protease mechanisme. De specificiteit en de selectiviteit worden in belangrijke mate bepaald door de primaire bindingsplaats en een aantal subbindingsplaatsen voor aangrenzende aminozuren. De substraatspecificiteit van DPP-IV voor natuurlijke peptiden kon niet voorspeld worden op basis van deze veronderstellingen en de gegevens bekomen met kleine dipeptide-afgeleide substraten. Solvent isotoop-effecten lieten niet toe ondubbelzinnig de snelste stap in het mechanisme te identificeren. In bepaalde condities blijkt een conformatieverandering snelheidsbepalend te zijn voor de PO gekatalyseerde hydrolyse van chromogene substraten. Ook blijft de interpretatie van structuur-activiteitsrelaties van remmers moeilijk. Doel van dit project is een beter inzicht te krijgen in de details van het katalytisch mechanisme van PO en DPP-IV. Verschillende benaderingswijzen worden overwogen: kinetische experimenten, gerichte mutagenese in het actief centrum en de putatieve substraatbindingsplaatsen in PO, kwantitatieve structuur-activiteitsrelaties van remmers en liganden.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
- Mandaathouder: Brandt Inger
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Chemokinen en chemokinereceptoren.
Onderzoeksactiviteiten in verband met moleculaire en immunologische aspecten van plasma-enzymen en plasma proteïnen in verschillende ziektetoestanden.
Moleculaire detectie en kwantificering van micrometastatische ziekte bij borstkankerpatiënten : optimalisering van de methode, klinische relevantie en associatie met tumor angiogenese.
Abstract
Eén vrouw op negen ontwikkelt een borstcarcinoom. Hoewel klinisch, biochemisch en radiologisch onderzoek, bij een overgrote meerderheid van deze patiënten geen ziekteuitbreiding op afstand laat aantonen, is de op dat ogenblik reeds bestaande haematogene uitzaaiing verantwoordelijk voor de morbiditeit en mortaliteit van deze ziekte. Het terugvinden van gedissemineerde tumorcellen in de bloedbaan en/of in het beenmerg van borstkankerpatiënten zou kunnen leiden tot een betere stadiëring en prognosestelling. De immunohistologische analyse van beenmerg en lymfeknopen, voor de opsporing van morfologisch aantoonbare tumorcellen is hierbij het meest beproefd. Deze microscopische methodologie is voornamelijk beperkt door een lage gevoeligheid waardoor het opsporen van slechts in geringe getale aanwezige tumorcellen problematisch blijft. De moleculaire biologische technologie kent een veel hogere sensitiviteit maar de specificiteit vormt hier echter de beperking. Het doel van dit onderzoek is om een gevoelige en specifieke moleculair biologische technologie te ontwikkelen om micrometastatische ziekte op te sporen bij borstkankerpatiënten en deze rechtstreeks te vergelijken met de morfologie. Tumorcellen in het perifeer bloed en beenmerg zullen worden opgespoord met een reverse-transcriptase polymerase ketting reactie (RT-PKR) voor de amplificatie van het boodschapper RNA (mRNA) voor cytokeratine-19 (CK19), een eiwit specifiek voor epitheelcellen. Door gebruik te maken van een cDNA specifieke primer/probe set voor CK19 en de ABI Prism 7700 Real-Time PCR (TaqmanTM) kan het resultaat kwantitatief uitgedrukt worden. Het resultaat bekomen met behulp van deze moleculair biologische techniek zal vergeleken worden met deze van de immunohistochemie. In een tweede fase van het onderzoek zal nagegaan worden wat de prognostische waarde is van deze parameter(s) voor metastasering en overleving bij patiënten met operabel borstcarcinoom. Er zal ook getracht worden een antwoord te vinden op de vraag of het verschil in aantal tumorcellen detecteerbaar in beenmerg voor en na behandeling, ons iets kan vertellen over het succes van de behandeling. In een derde deel van de studie zal worden onderzocht of er een associatie bestaat tussen de aanwezigheid van gedissemineerde tumorcellen en tumorangiogenese.Onderzoeker(s)
- Promotor: Van Marck Eric
- Co-promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: Benoy Ina
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Dipeptidylpeptidase IV : een specifieke metabole regulator of een multifunctioneel peptidase ?
Abstract
Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Co-promotor: De Meester Ingrid
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Moleculaire en cellulaire effecten geinduceerd door inhibitoren van proline-specifieke peptidasen.
Abstract
De conformationele restricties die door proline worden opgelegd aan peptideketens impliceren structurele en biologische functies voor dit aminozuur. Dit wordt afgeleid uit de hoge graad van conservatie van proline bij cytokinen, chemokinen, groeifactoren, G-proteïne gekoppelde receptoren, de V3 lus van het HIV mantelglycoproteïne gp120, neuro- en vascoactieve peptiden. De impact van proline bevattende peptiden op de moleculaire regulatie van bloeddruk, stolling, immunologische systeem en neurotransmissie maakt dat enzymen een belangrijke rol spelen in de modulatie van biologische functies.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: Durinx Christine
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Onderzoek naar de werking van het enzyme dipeptidyl peptidase IV.
Abstract
Het enzyme dipeptidyl peptidase IV ook gedefinieerd als het activatie-antigeen CD26, wordt bestudeerd. Er wordt getracht een beter inzicht te verkrijgen in de structuur en functie van dit proline-specifieke exopeptidase dat voorkomt als ectopeptidase op geactiveerde lymfocyten en op bepaalde endotheel en epitheelcellen. Momenteel gaat de aandacht vooral uit naar de identificatie van de natuurlijke substraten. Kandidaat substraten omvatten welbepaalde chemokinen, neuropeptiden en groeifactoren.Onderzoeker(s)
- Promotor: De Meester Ingrid
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Specialized bio-analytical and protein processing services agreement on regulatory peptides + patent agreement.
Abstract
Onderzoeker(s)
- Promotor: Hendriks Dirk
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Selectieve immuunsuppressie via de CD26/DPPIV T cel activatiemerker.
Abstract
Het bewijs dat CD26 betrokken is in T cell activatie wordt geleverd door het gebruik van mAb en CD26 transfectie in menselijke leukemie T cell lijnen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Co-promotor: De Meester Ingrid
- Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Dipeptidyl peptidase IV : interactie met liganden en functionele rol.
Abstract
In deze studie exploreren we de structuur en de functie van het lymfocytaire activatieantigen CD26, dat werd geïdentificeerd als het proline-specifieke serine-protease dipeptidyl peptidase IV. Met behulp van specifieke inhibitoren en monoclonale antilichamen trachten we de rol van CD 26 in lymfocytactivatie na te gaan. Om structurele info te bekomen, zullen we trachten het proteasedomein tot expressie te brengen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: De Meester Ingrid
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Moleculaire en cellulaire effecten geinduceerd door inhibitoren van proline-specifieke peptidasen.
Abstract
De conformationele restricties die door proline worden opgelegd aan peptideketens impliceren structurele en biologische functies voor dit aminozuur. Dit wordt afgeleid uit de hoge graad van conservatie van proline bij cytokinen, chemokinen, groeifactoren, G-proteïne gekoppelde receptoren, de V3 lus van het HIV mantelglycoproteïne gp120, neuro- en vascoactieve peptiden. De impact van proline bevattende peptiden op de moleculaire regulatie van bloeddruk, stolling, immunologische systeem en neurotransmissie maakt dat enzymen een belangrijke rol spelen in de modulatie van biologische functies.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: Durinx Christine
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Selectieve immuunsuppressie via de CD26/DPPIV T celactivatiemerker.
Abstract
Het bewijs dat CD26 betrokken is in T cell activatie wordt geleverd door het gebruik van mAb en CD26 transfectie in menselijke leukemie T cell lijnen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Co-promotor: De Meester Ingrid
- Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Third party biochemical services agreement.
Abstract
Onderzoeker(s)
- Promotor: Hendriks Dirk
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Studies inzake eiwitontwerp met twee monomere tim-barrel eiwitten: naar nieuwe actieve sites van chitinase en monomere triosefosfaat isomerase.(MONOTIM)
Abstract
Het objectief van dit project is de studie van structurele determinanten met betrekking tot enzymatische activiteit substraatspecificiteit en stabiliteit bij monomere TlM-barrel eiwitten, in casu monoTlM en twee onderling verwante chitinases. Uiteindelijk zou deze studie moeten leiden tot het gebruik van het TlM-barrel motief voor het ontwerpen van enzymes met specifiek gewijzigde eigenschappen. Door veranderingen aan te brengen op specifieke plaatsen zal een poging worden gedaan om monoTlM om te vormen tot een xylose isomerase. Het doel van de chitinase studie is het bekomen van een kleiner, actiever en stabieler enzym met rationeel bepaalde substraatspecificiteit.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Co-promotor: Lambeir Anne-Marie
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Structurele studie van proline-specifieke serine proteasen.
Abstract
De proline-specifieke serine proteasen vormen een nieuwe familie met enerzijds een afwijkende lineaire volgorde van de katalytische triade en anderzijds een karakteristieke consensussequentie rond de actieve serine. Het doel is om met behulp van diverse technieken en strategieen inzicht te ververven in de moleculaire opbouv van verschillende enzymen die behoren tot deze nieuwe familie zoals dipeptidylpeptidase IV en prolyloligopeptidase.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Celbiologie in de geneeskunde (bursaal Belyaev op IUAP-II).
Een multivariate analyse en functioneel onderzoek van intercellulaire signaalmolecules bij psychiatrische ziektebeelden.
Abstract
Onderzoeker(s)
- Co-promotor: Cosyns Paul
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Bereiding en biologische evaluatie van DPP IV inhibitoren als mogelijke immunomodulerende verbindingen.
Abstract
Dipeptidyl peptidase IV speelt een belangrijke rol bij de activatie van T-lymfocyten, o.m. door stimulatie van de vrijstelling van interleukine-2. inhibitoren van dit enzym zijn mogelijke geneesmiddelen bij allergische en inflammatoire aandoeningen. Deze verbindingen zullen via rationele "drug design" technieken ontwikkeld worden.Onderzoeker(s)
- Promotor: Haemers Achiel
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Dipeptidyl peptidase IV/cd 26 : studie naar interacties met liganden en functionele rol.
Abstract
In deze studie exploreren we de structuur en de functie van het lymfocytaire activatieantigen CD26, dat werd geïdentificeerd als het proline-specifieke serine-protease dipeptidyl peptidase IV. Met behulp van specifieke inhibitoren en monoclonale antilichamen trachten we de rol van CD 26 in lymfocytactivatie na te gaan. Om structurele info te bekomen, zullen we trachten het proteasedomein tot expressie te brengen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: De Meester Ingrid
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Selectieve immuunsuppressie via de CD26/DPPIV T cel activatiemerker.
Abstract
Het bewijs dat CD26 betrokken is in T cell activatie wordt geleverd door het gebruik van mAb en CD26 transfectie in menselijke leukemie T cell lijnen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Expressie en site-directed mutagenese van het gen coderend voor prolynoligopeptidase.
Abstract
Prolyl oligopeptidase maakt deel uit van een nieuwe familie van serineproteasen, heeft een unieke specificiteit voor proline en geniet vanwege de aard van zijn substraten van een toenemende farmaceutische belangstelling. Via site directed mutagenese en expressie van het gen coderend voor prolyl oligopeptidase wordt het katalytisch mechanisme van de nieuwe serineprotease familie bestudeerd.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: Vanhoof Greta
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Celbiologie in de geneeskunde.
Abstract
Het T-lymfocytair dipeptidylpeptidase IV speelt een belangrijke rol bij de activatie van het immuunsysteem. Inhibitoren van dit enzyme kunnen een belangrijke bijdrage leveren tot de opheldering van de rol van groeifactoren en cytokines.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Rol van cytokines, peptidase en acute fase proteinen in de pathogenese en pathofysiologie van ernstige depressieve stoornis.
Abstract
Deze studie zou een verregaande verbetering moeten vertonen in vergelijking met vroegere resultaten wat betreft het testen van de hypothese dat cytokines en peptidase enzymen betrokken zijn in de pathogenese van ernstige depressieve stoornissen en gerelateerd kunnen worden aan lagere L-TRP beschikbaarheid bij deze ziekte.Onderzoeker(s)
- Promotor: Cosyns Paul
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Procesontwikkeling en pilootzuivering van lymfocyten DPPIV, trombocyten aminopeptidasen P en serum anaphylatoxine inactivatoren
Abstract
Ontwikkeling en karakterisatie van nieuwe celmerkers voor diagnostiek. Exploratie van nieuwe aangrijpingspunten voor synthese van biologische compatibele inhibitoren met het oog op therapeutische toepassingen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Structuur en functie van het humaan lymfocytair activatie antigeen CD26 (dipeptidyl peptidase IV).
Abstract
In deze studie exploreren we de structuur en de functie van het lymfocytaire activatieantigen CD26, dat werd geïdentificeerd als het proline-specifieke serine-protease dipeptidyl peptidase IV. Met behulp van specifieke inhibitoren en monoclonale antilichamen trachten we de rol van CD 26 in lymfocytactivatie na te gaan. Om structurele info te bekomen, zullen we trachten het proteasedomein tot expressie te brengen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: De Meester Ingrid
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Inzicht verkrijgen in de rol die het humaan lymfocytair DPP IV vervult in de activatie van de T-cel
Abstract
De cruciale rol van de celoppervlakte peptidasen en cytosol-isomerasen kan geanalyseerd worden door een grondige exploratie van hun structuurfunctie relatie. Hiertoe zal getracht worden de ruimtelijke structuur te bepalen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Proline specifieke aminopeptidasen : de proteolytische regulatie van biologisch actieve peptiden : onderzoek naar inhibitoren en hun klinische toepassingen
Abstract
De proline-specifieke aminopeptidasen dipeptidyl peptidase IV en aminopeptidase P worden respectievelijk gezuiverd uit humane lymfocyten en bloedplaatjes. De biochemische en enzymatische karakteristieken van de gezuiverde enzymen worden, samen met hun activiteit ten opzichte van biologisch actieve peptiden, onderzocht.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: Vanhoof Greta
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Proline endopeptidase als proteolytische regulatie van biologisch actieve peptiden
Abstract
Dit serine protease splitst de peptide keten langs de carboxy zijde van proline. Nadat de fysico-chemische eigenschappen werden onderzocht zal de zuivering gestart worden. Het gezuiverd enzym moet ons toelaten om zijn proteolytische werking en de moleculaire structuur te achterhalen.Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: Goossens Filip Ja
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Proteolytische regulatie van biologisch actieve peptiden bij de mens doorectopeptidasen.
Bereiding en biologische evaluatie van dipeptidyl peptidase IV-inhibitoren als mogelijke immunomodulerende verbindingen
Abstract
Dipeptidyl peptidase IV speelt een belangrijke rol bij de activatie van T-lymfocyten, o.m. door stimulatie van de vrijstelling van interleukine-2. inhibitoren van dit enzym zijn mogelijke geneesmiddelen bij allergische en inflammatoire aandoeningen. Deze verbindingen zullen via rationele "drug design" technieken ontwikkeld worden.Onderzoeker(s)
- Promotor: Haemers Achiel
- Co-promotor: Scharpe Simon
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Onderzoek naar de eigenschappen en biologische functies van dipeptidyl deptidaseIV
Abstract
Het dipeptidyl peptidase IV wordt uit humane lymfocyten gezuiverd; de biochemische karakteristieken (zoals MW, isoelectrisch punt en glycrilatie) worden onderzocht envenals de enzymatische eigenschappenOnderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: De Meester Ingrid
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Proline specifieke aminopeptidasen: de proteolytische regulatie van biologisch actieve peptiden; onderzoek naar inhibitoren en hun klinische toepassingen.
Abstract
Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: Vanhoof Greta
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject
Proline endopeptidase als proteolytische regulatie van biologisch actieve peptiden.
Abstract
Onderzoeker(s)
- Promotor: Scharpe Simon
- Mandaathouder: Goossens Filip Ja
Onderzoeksgroep(en)
Project type(s)
- Onderzoeksproject